.PROT 文件扩展名

XEASY原子列表

开发者 ETH Zurich
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什么是 PROT 文件?

PROT文件是由XEASY创建和使用的原子列表,XEASY是一款核磁共振(NMR)谱图分析应用程序。它是一个描述原子核磁共振的纯文本文件。PROT文件 предназначены? предназначены to be opened and viewed in XEASY, using the Load atoms option.

更多信息

科学家和研究人员可以使用XEASY通过NMR对大分子进行3D谱图分析。XEASY记录的测量数据之一就是大分子的原子列表。原子列表包含大分子共振的名称和频率,并保存为PROT文件。

每个PROT文件都包含若干行数值和文本值。每一行对应一个单独的原子,并包含该原子的识别信息。按顺序,每个原子所在的行包括:

  • 原子的唯一ID编号
  • 原子的平均化学位移(百万分之一)
  • 原子已分配峰相对于平均值的偏差
  • 原子的名称
  • 原子的片段编号
  • 原子的参考线形

要在XEASY中创建原子列表,科学家会使用该程序的Write atoms (chem.shift) [wc]命令。该命令会为当前大分子生成一个PROT文件。

如何打开 PROT 文件

你可以在XEASY(Linux)中使用程序的Load atoms (chem.shift) [lc]命令打开PROT文件。

如果你无法使用XEASY,也可以在任何文本编辑器中打开PROT文件,以查看其中包含的原子列表。

使用File Viewer Plus打开 400 多种文件格式。免费下载

可打开 PROT 文件的程序

Windows
操作系统自带
Mac
操作系统自带
Linux
ETH Zurich XEASY
免费
分类:数据
更新时间:2021年8月27日

SnapGene蛋白质文件

开发者 GSL Biotech
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PROT文件是由GSL Biotech SnapGene(一款分子生物学分析应用程序)创建的数据文件。它包含蛋白质序列及其属性,例如分子量和吸光度。PROT文件包含元数据,例如创建者、序列描述、修改历史和注释。

更多信息

在 GSL Biotech SnapGene 6 中打开的 .prot 文件截图
在 GSL Biotech SnapGene 6 中打开的 PROT 文件

SnapGene是一款分子生物学应用程序,可记录、设计和模拟各种类型的序列,包括DNA、RNA和蛋白质。当你使用SnapGene保存序列时,该软件会创建一个文件来存储其内容。Snap Gene会将每种类型的序列保存为不同的文件格式:

  • DNA序列 - .DNA文件
  • RNA序列 - .RNA文件
  • 蛋白质序列 - PROT文件

要使用SnapGene创建PROT文件,请按照以下步骤操作:

  1. 选择File → New Protein File...
  2. 选择“RNA”序列类型
  3. 创建序列
  4. 为文件命名
  5. 选择OK

创建PROT文件后,你可以选择File → Save或Save As...来保存它。保存文件后,你可以将其关闭,然后重新打开以进一步修改序列。

如何打开 PROT 文件

你可以使用GSL Biotech SnapGene(多平台)打开PROT文件。要使用SnapGene打开PROT文件,请选择File → Open Files...。

你也可以使用SnapGene Viewer(多平台)打开PROT文件。不过,它不具备SnapGene提供的相同高级功能。

如何转换 PROT 文件

GSL Biotech SnapGene可以将PROT文件转换为各种文件类型,包括以下格式:

  • .SEQ - DNA序列文本文件
  • .FA - FASTA序列文件
  • .EMBL - EMBL序列数据文件
  • .GBK - GenBank数据文件
  • .TXT - 纯文本文件
  • .JPG - JPEG图像
  • .PNG - Portable Network Graphic
  • .EMF - Enhanced Windows Metafile
  • .SVG - Scalable Vector Graphics文件
  • .PDF - Portable Document Format

可打开 PROT 文件的程序

分类:数据
更新时间:2022年11月11日

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