.PROT 文件扩展名
XEASY原子列表
| 开发者 | ETH Zurich |
| 受欢迎程度 |
2.3 | 3 票 |
什么是 PROT 文件?
PROT文件是由XEASY创建和使用的原子列表,XEASY是一款核磁共振(NMR)谱图分析应用程序。它是一个描述原子核磁共振的纯文本文件。PROT文件 предназначены? предназначены to be opened and viewed in XEASY, using the Load atoms option.
更多信息
科学家和研究人员可以使用XEASY通过NMR对大分子进行3D谱图分析。XEASY记录的测量数据之一就是大分子的原子列表。原子列表包含大分子共振的名称和频率,并保存为PROT文件。
每个PROT文件都包含若干行数值和文本值。每一行对应一个单独的原子,并包含该原子的识别信息。按顺序,每个原子所在的行包括:
- 原子的唯一ID编号
- 原子的平均化学位移(百万分之一)
- 原子已分配峰相对于平均值的偏差
- 原子的名称
- 原子的片段编号
- 原子的参考线形
要在XEASY中创建原子列表,科学家会使用该程序的Write atoms (chem.shift) [wc]命令。该命令会为当前大分子生成一个PROT文件。
如何打开 PROT 文件
你可以在XEASY(Linux)中使用程序的Load atoms (chem.shift) [lc]命令打开PROT文件。
如果你无法使用XEASY,也可以在任何文本编辑器中打开PROT文件,以查看其中包含的原子列表。
可打开 PROT 文件的程序
SnapGene蛋白质文件
| 开发者 | GSL Biotech |
| 受欢迎程度 |
2.0 | 1 票 |
PROT文件是由GSL Biotech SnapGene(一款分子生物学分析应用程序)创建的数据文件。它包含蛋白质序列及其属性,例如分子量和吸光度。PROT文件包含元数据,例如创建者、序列描述、修改历史和注释。
更多信息
SnapGene是一款分子生物学应用程序,可记录、设计和模拟各种类型的序列,包括DNA、RNA和蛋白质。当你使用SnapGene保存序列时,该软件会创建一个文件来存储其内容。Snap Gene会将每种类型的序列保存为不同的文件格式:
要使用SnapGene创建PROT文件,请按照以下步骤操作:
- 选择File → New Protein File...
- 选择“RNA”序列类型
- 创建序列
- 为文件命名
- 选择OK
创建PROT文件后,你可以选择File → Save或Save As...来保存它。保存文件后,你可以将其关闭,然后重新打开以进一步修改序列。
如何打开 PROT 文件
你可以使用GSL Biotech SnapGene(多平台)打开PROT文件。要使用SnapGene打开PROT文件,请选择File → Open Files...。
你也可以使用SnapGene Viewer(多平台)打开PROT文件。不过,它不具备SnapGene提供的相同高级功能。
