.PROT Estensione file

Gli scienziati e i ricercatori possono utilizzare XEASY per eseguire l'analisi 3D dello spettro di macromolecole tramite NMR. Una delle misurazioni che XEASY registra è l'elenco degli atomi di una macromolecola. L'elenco degli atomi contiene i nomi e le frequenze delle risonanze di una macromolecola e viene salvato come file PROT.

Ogni file PROT contiene diverse righe di valori numerici e testuali. Ogni riga corrisponde a un singolo atomo e contiene informazioni identificative su quell'atomo. Nell'ordine, la riga di ogni atomo include:

• Il numero ID univoco dell'atomo
• Lo spostamento chimico medio dell'atomo in parti per milione
• La deviazione dei picchi assegnati all'atomo dal valore medio
• Il nome dell'atomo
• Il numero del frammento dell'atomo
• Le forme di riga di riferimento dell'atomo

Per creare un elenco di atomi in XEASY, gli scienziati utilizzano il comando del programma Write atoms (chem.shift) [wc]. Questo comando produce un file PROT per la macromolecola corrente.

Puoi aprire un file PROT in XEASY (Linux), utilizzando il comando del programma Load atoms (chem.shift) [lc].

Se non hai accesso a XEASY, puoi anche aprire un file PROT in qualsiasi editor di testo per visualizzare l'elenco degli atomi che contiene.