.PROT 파일 확장자
XEASY 원자 목록
| 개발사 | ETH Zurich |
| 인기도 |
2.3 | 3 표 |
PROT 파일이란 무엇인가요?
PROT 파일은 핵자기 공명(NMR) 스펙트럼 분석 애플리케이션인 XEASY에서 생성하고 사용하는 원자 목록입니다. 일반 텍스트 파일로, 원자의 핵자기 공명을 설명합니다. PROT 파일은 Load atoms 옵션을 사용하여 XEASY에서 열고 볼 수 있습니다.
추가 정보
과학자와 연구자는 NMR을 사용하여 XEASY로 고분자의 3D 스펙트럼 분석을 수행할 수 있습니다. XEASY가 기록하는 측정값 중 하나는 고분자의 원자 목록입니다. 원자 목록에는 고분자 공명의 이름과 주파수가 포함되며, PROT 파일로 저장됩니다.
각 PROT 파일에는 숫자와 텍스트 값으로 이루어진 여러 행이 포함되어 있습니다. 각 행은 개별 원자에 해당하며 해당 원자를 식별하는 정보를 포함합니다. 각 원자의 행에는 다음 정보가 순서대로 포함됩니다.
- 원자의 고유 ID 번호
- 원자의 평균 화학적 이동(백만분율)
- 할당된 피크와 평균값의 편차
- 원자의 이름
- 원자의 조각 번호
- 원자의 참조 라인셰이프
XEASY에서 원자 목록을 만들려면 과학자는 프로그램의 Write atoms (chem.shift) [wc] 명령을 사용합니다. 그러면 현재 고분자에 대한 PROT 파일이 생성됩니다.
PROT 파일을 여는 방법
프로그램의 Load atoms (chem.shift) [lc] 명령을 사용하여 XEASY(Linux)에서 PROT 파일을 열 수 있습니다.
XEASY에 액세스할 수 없는 경우 텍스트 편집기에서 PROT 파일을 열어 파일에 포함된 원자 목록을 볼 수도 있습니다.
PROT 파일을 여는 프로그램
SnapGene 단백질 파일
| 개발사 | GSL Biotech |
| 인기도 |
2.0 | 1 표 |
PROT 파일은 분자 생물학 분석 애플리케이션인 GSL Biotech SnapGene이 만든 데이터 파일입니다. 이 파일에는 단백질 서열과 분자량 및 흡광도와 같은 단백질의 특성이 포함되어 있습니다. PROT 파일에는 작성자, 서열 설명, 변경 기록, 주석과 같은 메타데이터도 포함됩니다.
추가 정보
SnapGene은 DNA, RNA, 단백질을 비롯한 다양한 유형의 서열을 기록하고, 설계하고, 시뮬레이션하는 분자 생물학 애플리케이션입니다. SnapGene으로 서열을 저장하면 소프트웨어가 내용을 저장할 파일을 만듭니다. Snap Gene은 각 서열 유형을 서로 다른 파일 형식으로 저장합니다:
SnapGene으로 PROT 파일을 만들려면 다음 단계를 따르세요:
- File → New Protein File... 선택
- "RNA" 서열 유형 선택
- 서열 만들기
- 파일 이름 지정
- OK 선택
PROT 파일을 만든 후 File → Save 또는 Save As...를 선택하여 저장할 수 있습니다. 그런 다음 파일을 저장한 후 파일을 닫았다가 다시 열어 서열을 추가로 수정할 수 있습니다.
PROT 파일을 여는 방법
GSL Biotech SnapGene(멀티플랫폼)으로 PROT 파일을 열 수 있습니다. SnapGene으로 PROT 파일을 열려면 File → Open Files...을 선택하세요.
SnapGene Viewer(멀티플랫폼)로도 PROT 파일을 열 수 있습니다. 하지만 SnapGene에서 제공하는 것과 동일한 고급 기능은 제공하지 않습니다.
PROT 파일을 변환하는 방법
GSL Biotech SnapGene은 PROT 파일을 다음을 포함한 다양한 파일 형식으로 변환할 수 있습니다:
