.PROT Bestandsextensie

Wetenschappers en onderzoekers kunnen XEASY gebruiken om een 3D-spectrumanalyse van macromoleculen uit te voeren met behulp van NMR. Een van de metingen die XEASY vastlegt, is de atomenlijst van een macromolecuul. De atomenlijst bevat de namen en frequenties van de resonanties van een macromolecuul en wordt opgeslagen als een PROT-bestand.

Elk PROT-bestand bevat meerdere rijen met numerieke en tekstwaarden. Elke rij komt overeen met een afzonderlijk atoom en bevat identificerende informatie over dat atoom. In volgorde bevat de rij van elk atoom:

• Het unieke ID-nummer van het atoom
• De gemiddelde chemische verschuiving van het atoom in parts per miljoen
• De afwijking van de toegewezen pieken van het gemiddelde
• De naam van het atoom
• Het fragmentnummer van het atoom
• De referentielijnprofielen van het atoom

Om een atomenlijst te maken in XEASY gebruiken wetenschappers de opdracht Write atoms (chem.shift) [wc] van het programma. Hiermee wordt een PROT-bestand voor het huidige macromolecuul gemaakt.

Je kunt een PROT-bestand openen in XEASY (Linux) met de opdracht Load atoms (chem.shift) [lc] van het programma.

Als je geen toegang hebt tot XEASY, kun je een PROT-bestand ook openen in elke teksteditor om de atomenlijst te bekijken die het bevat.