.FASTA 文件扩展名

FASTA序列文件

开发者 David J. Lipman and William R. Pearson
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什么是 FASTA 文件?

FASTA文件包含以基于文本的FASTA格式保存的核酸序列记录(例如DNA序列)或蛋白质序列。它可以存储一个或多个序列,因此FASTA有时也被称为FASTA数据库格式。你可以使用DNA分析软件查看和分析FASTA文件。

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在 GSL Biotech SnapGene 6 中打开的 .fasta 文件截图
在 GSL Biotech SnapGene 6 中打开的 FASTA 文件

David J. Lipman和William R. Pearson创建了FASTA格式,并于1985年发布。许多DNA应用程序都采用了对该格式的支持,因为它简单易用,使FASTA成为应用程序之间传输序列时最常用的格式之一。

FASTA格式

FASTA文件通常以标题行开头,其中可能包含注释或其他信息。文件的其余部分包含序列数据。每个序列都以>字符开头,后面跟着序列名称。该行的其余部分描述序列,剩余各行则包含序列本身。

注: 以FASTA格式保存的文件除了.fasta之外,还可能使用各种文件扩展名,例如.fas(.FAS文件)和.fa(.FA文件)。

如何打开 FASTA 文件

你可以使用多种DNA应用程序打开FASTA文件,例如GSL Biotech SnapGene(多平台)、Genome Compiler(多平台)和Heracle BioSoft DNA Baser(Windows)。例如,你可以在SnapGene中选择File → Open Files...来打开FASTA文件。

使用文本编辑器打开FASTA文件

FASTA file open in Apple TextEdit 1
FASTA file open in Apple TextEdit 1

你也可以使用文本编辑器打开FASTA文件,例如Microsoft Notepad(Windows)或Apple TextEdit(Mac)。你还可以使用源代码编辑器打开FASTA文件。但是,使用文本编辑器或源代码编辑器打开FASTA文件时,不会像DNA应用程序那样原生显示FASTA文件中的序列。

在文本编辑器或源代码编辑器中打开后,你可以查看FASTA文件中的序列并修改其属性。但是,如果你错误地编辑序列,可能会损坏该序列。

如何转换 FASTA 文件

多种应用程序都可以将FASTA文件转换为其他格式,例如GSL Biotech SnapGene和Heracle BioSoft DNA Baser。

例如,SnapGene可以将FASTA文件转换为以下格式:

  • .DNA - SnapGene DNA文件
  • .SEQ - DNA序列文本文件
  • .EMBL - EMBL序列数据文件
  • .GBK - GenBank数据文件
  • .TXT - 纯文本文件
  • .JPG - JPEG图像
  • .PNG - 可移植网络图形文件
  • .SVG - 可缩放矢量图形文件
  • .PDF - 可移植文档格式
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可打开 FASTA 文件的程序

Mac
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免费
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Linux
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Web
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分类:数据
更新时间:2022年10月13日

经 FileInfo.com 验证

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