.FASTA ファイル拡張子
FASTA配列ファイル
| 開発元 | David J. Lipman and William R. Pearson |
| 人気度 |
3.7 | 29 票 |
FASTAファイルとは？
FASTAファイルには、テキストベースのFASTA形式で保存された核酸配列（DNA配列など）またはタンパク質配列の記録が含まれています。1つまたは複数の配列を保存できるため、FASTAはFASTAデータベース形式と呼ばれることもあります。ユーザーはDNA解析ソフトウェアでFASTAファイルを表示および分析できます。
詳細情報
David J. LipmanとWilliam R. PearsonがFASTA形式を作成し、1985年に公開しました。多くのDNAアプリが、そのシンプルさからこの形式に対応しており、アプリケーション間で配列を転送するための最も一般的な形式の1つになっています。
FASTA形式
FASTAファイルは、コメントやその他の情報を含むヘッダー行で始まることがよくあります。ファイルの残りの部分には配列データが含まれています。各配列は>文字の後に配列名が続く形で始まります。行の残りの部分には配列の説明が記載され、残りの行には配列そのものが含まれています。
注: FASTA形式で保存されたファイルには、.fasta以外にも、.fas（.FASファイル）や.fa（.FAファイル）など、さまざまなファイル拡張子が使用されることがあります。
FASTAファイルの開き方
GSL Biotech SnapGene（マルチプラットフォーム）、Genome Compiler（マルチプラットフォーム）、Heracle BioSoft DNA Baser（Windows）など、複数のDNAアプリケーションでFASTAファイルを開くことができます。たとえば、SnapGeneでFASTAファイルを開くには、を選択します。
テキストエディターでFASTAファイルを開く
Microsoft Notepad（Windows）やApple TextEdit（Mac）などのテキストエディターでもFASTAファイルを開くことができます。ソースコードエディターでFASTAファイルを開くこともできます。ただし、テキストエディターやソースエディターでFASTAファイルを開いても、DNAアプリのようにFASTAファイル内の配列が本来の形で表示されるわけではありません。
テキストエディターやソースコードエディターで開くと、FASTAファイル内の配列を表示し、そのプロパティを変更できます。ただし、配列を誤って編集すると、破損する可能性があります。
FASTAファイルの変換方法
GSL Biotech SnapGeneやHeracle BioSoft DNA Baserなど、さまざまなアプリケーションでFASTAファイルを他の形式に変換できます。
たとえば、SnapGeneではFASTAファイルを次の形式に変換できます。