.FASTA Estensione file
File di sequenze FASTA
| Sviluppatore | David J. Lipman and William R. Pearson |
| Popolarità |
3,7 | 29 Voti |
Che cos'è un file FASTA?
Un file FASTA contiene un record di sequenze di acidi nucleici (come le sequenze di DNA) o di proteine salvate nel formato FASTA basato sul testo. Può memorizzare una o più sequenze, per questo a volte FASTA viene definito formato di database FASTA. Puoi visualizzare e analizzare i file FASTA con software per l'analisi del DNA.
Maggiori informazioni
David J. Lipman e William R. Pearson hanno creato il formato FASTA e lo hanno rilasciato nel 1985. Molte app per il DNA hanno adottato il supporto per questo formato grazie alla sua semplicità, rendendolo uno dei formati più comuni per trasferire sequenze tra applicazioni.
Il formato FASTA
I file FASTA iniziano spesso con una riga di intestazione che può contenere commenti o altre informazioni. Il resto del file contiene i dati della sequenza. Ogni sequenza inizia con un carattere > seguito dal nome della sequenza. Il resto della riga descrive la sequenza, mentre le righe successive contengono la sequenza stessa.
NOTA: I file salvati nel formato FASTA possono usare diverse estensioni oltre a .fasta, come .fas (file .FAS) e .fa (file .FA).
Come aprire un file FASTA
Puoi aprire un file FASTA con diverse applicazioni per il DNA, come GSL Biotech SnapGene (multipiattaforma), Genome Compiler (multipiattaforma) e Heracle BioSoft DNA Baser (Windows). Ad esempio, puoi aprire un file FASTA con SnapGene selezionando .
Aprire un file FASTA con un editor di testo
Puoi anche aprire un file FASTA con un editor di testo, come Microsoft Notepad (Windows) o Apple TextEdit (Mac). Puoi anche aprire un file FASTA con editor di codice sorgente. Tuttavia, l'apertura del file FASTA con un editor di testo o un editor di codice sorgente non visualizzerà in modo nativo la sequenza contenuta nel file FASTA come farebbe un'app per il DNA.
Quando apri il file con un editor di testo o un editor di codice sorgente, puoi visualizzare la sequenza contenuta nel file FASTA e modificarne le proprietà. Tuttavia, se modifichi la sequenza in modo errato, potresti danneggiarla.
Come convertire un file FASTA
Diverse applicazioni, come GSL Biotech SnapGene e Heracle BioSoft DNA Baser, possono convertire i file FASTA in altri formati.
Ad esempio, SnapGene può convertire i file FASTA nei seguenti formati: