.FAS Estensione file
File di sequenza FASTA
| Sviluppatore | David J. Lipman and William R. Pearson |
| Popolarità |
3,2 | 6 Voti |
Un file FAS è un file di testo normale salvato nel formato FASTA, un formato di file usato per archiviare sequenze di acidi nucleici e proteine. Contiene una o più sequenze, che includono un codice di identificazione della sequenza e la sequenza. Gli studenti di biochimica, gli accademici e i professionisti possono usare i file FAS per archiviare ed elaborare informazioni bioinformatiche, come i genomi di specie diverse.
Maggiori informazioni
David J. Lipman e William R. Pearson hanno creato il formato FASTA e lo hanno pubblicato nel 1985. Da allora è diventato un formato standard per trasferire sequenze tra applicazioni grazie alla sua semplicità.
Il formato FASTA
Il formato FASTA è semplice e consiste nei seguenti elementi:
- Una riga che inizia con il carattere >, seguito da un codice di identificazione della sequenza. Dopo il codice può essere presente una descrizione testuale della sequenza, ma è facoltativa e il software per il DNA potrebbe ignorarla.
- La riga successiva contiene la sequenza stessa, che può occupare più di una riga.
NOTA: I file FAS possono essere salvati con altre estensioni, come .fasta (file .FASTA) e .fa (file .FA), ma vengono salvati nello stesso formato FASTA.
Come aprire un file FAS
Puoi aprire un file FAS con varie applicazioni per il DNA, come GSL Biotech SnapGene (multipiattaforma), Genome Compiler (multipiattaforma) e Heracle BioSoft DNA Baser (Windows). Per aprire un file FAS con SnapGene, seleziona .
Aprire un file FAS con un editor di testo
Poiché i file FAS vengono salvati come testo normale, puoi aprirli anche con un editor di testo, come Microsoft Notepad (Windows) o Apple TextEdit (Mac), oppure con un editor di codice sorgente. Tieni presente che un editor di testo o di codice sorgente non visualizzerà nativamente la sequenza nel file FAS come farebbe un'applicazione per il DNA. Inoltre, potrebbe essere necessario rinominare l'estensione .fas in .txt affinché l'editor di testo la riconosca.
Quando apri un file FAS in un editor di testo o di codice sorgente, puoi modificarne le proprietà, inclusa la sequenza. Tuttavia, se modifichi il file in modo errato, potresti danneggiare la sequenza.
Come convertire un file FAS
Diverse applicazioni, tra cui GSL Biotech SnapGene e Heracle BioSoft DNA Baser, possono convertire i file FAS in altri formati.
Ad esempio, SnapGene può convertire i file FAS nei seguenti formati: