.FAS Dateiendung
FASTA-Sequenzdatei
| Entwickler | David J. Lipman and William R. Pearson |
| Beliebtheit |
3,2 | 6 Stimmen |
Eine FAS-Datei ist eine im FASTA-Format gespeicherte Nur-Text-Datei, einem Dateiformat zum Speichern von Nukleinsäure- und Proteinsequenzen. Sie enthält eine oder mehrere Sequenzen, die einen Sequenzidentifikationscode und die Sequenz umfassen. Biochemie-Studierende, Wissenschaftler und Fachleute können FAS-Dateien zum Speichern und Verarbeiten von Bioinformatikdaten verwenden, beispielsweise der Genome verschiedener Arten.
Weitere Informationen
David J. Lipman und William R. Pearson entwickelten das FASTA-Format und veröffentlichten es 1985. Seitdem hat es sich aufgrund seiner Einfachheit zu einem Standardformat für die Übertragung von Sequenzen zwischen Anwendungen entwickelt.
Das FASTA-Format
Das FASTA-Format ist einfach aufgebaut und besteht aus den folgenden Elementen:
- Eine Zeile, die mit dem Zeichen > beginnt, gefolgt von einem Sequenzidentifikationscode. Nach dem Code kann eine Textbeschreibung der Sequenz stehen, dies ist jedoch optional, und die DNA-Software ignoriert sie möglicherweise.
- Die nächste Zeile enthält die Sequenz selbst, die sich über mehrere Zeilen erstrecken kann.
HINWEIS: FAS-Dateien können mit anderen Dateierweiterungen gespeichert werden, beispielsweise .fasta (.FASTA-Dateien) und .fa (.FA-Dateien), werden aber im selben FASTA-Format gespeichert.
So öffnen Sie eine FAS-Datei
Sie können eine FAS-Datei mit verschiedenen DNA-Anwendungen öffnen, beispielsweise GSL Biotech SnapGene (plattformübergreifend), Genome Compiler (plattformübergreifend) und Heracle BioSoft DNA Baser (Windows). Um eine FAS-Datei mit SnapGene zu öffnen, wählen Sie .
Eine FAS-Datei mit einem Texteditor öffnen
Da FAS-Dateien als Nur-Text gespeichert werden, können Sie sie auch mit einem Texteditor wie Microsoft Notepad (Windows) oder Apple TextEdit (Mac) oder mit einem Quelltexteditor öffnen. Beachten Sie, dass ein Texteditor oder Quelltexteditor die Sequenz in der FAS-Datei nicht wie eine DNA-Anwendung nativ darstellt. Außerdem müssen Sie möglicherweise die Dateierweiterung .fas in .txt umbenennen, damit der Texteditor sie erkennt.
Wenn Sie die Datei in einem Texteditor oder Quelltexteditor öffnen, können Sie ihre Eigenschaften einschließlich der Sequenz ändern. Wenn Sie die Datei jedoch falsch bearbeiten, kann die Sequenz beschädigt werden.
So konvertieren Sie eine FAS-Datei
Mehrere Anwendungen, darunter GSL Biotech SnapGene und Heracle BioSoft DNA Baser, können FAS-Dateien in andere Formate konvertieren.
SnapGene kann FAS-Dateien beispielsweise in die folgenden Formate konvertieren: