.FAS Rozszerzenie pliku
Plik sekwencji FASTA
| Deweloper | David J. Lipman and William R. Pearson |
| Popularność |
3,2 | 6 Głosów |
Plik FAS to plik tekstowy zapisany w formacie FASTA — formacie używanym do przechowywania sekwencji kwasów nukleinowych i białek. Zawiera jedną lub więcej sekwencji, które obejmują kod identyfikacyjny sekwencji oraz samą sekwencję. Studenci biochemii, naukowcy i specjaliści mogą używać plików FAS do przechowywania i przetwarzania informacji bioinformatycznych, takich jak genomy różnych gatunków.
Więcej informacji
David J. Lipman i William R. Pearson stworzyli format FASTA i opublikowali go w 1985 roku. Od tego czasu stał się on standardowym formatem przesyłania sekwencji między aplikacjami ze względu na swoją prostotę.
Format FASTA
Format FASTA jest prosty i składa się z następujących elementów:
- Wiersz zaczynający się od znaku >, po którym następuje kod identyfikacyjny sekwencji. Po kodzie może znajdować się opis tekstowy sekwencji, ale jest on opcjonalny, a oprogramowanie DNA może go zignorować.
- Następny wiersz zawiera samą sekwencję, która może zajmować więcej niż jeden wiersz.
UWAGA: Pliki FAS mogą być zapisywane z innymi rozszerzeniami, takimi jak .fasta (.FASTA pliki) i .fa (.FA pliki), ale są zapisywane w tym samym formacie FASTA.
Jak otworzyć plik FAS
Plik FAS można otworzyć za pomocą różnych aplikacji do pracy z DNA, takich jak GSL Biotech SnapGene (wieloplatformowa), Genome Compiler (wieloplatformowa) i Heracle BioSoft DNA Baser (Windows). Aby otworzyć plik FAS w programie SnapGene, wybierz .
Otwieranie pliku FAS za pomocą edytora tekstu
Ponieważ pliki FAS są zapisywane jako zwykły tekst, można je również otwierać za pomocą edytora tekstu, takiego jak Microsoft Notepad (Windows) lub Apple TextEdit (Mac), albo edytora kodu źródłowego. Należy pamiętać, że edytor tekstu lub edytor kodu źródłowego nie wyświetli sekwencji w pliku FAS natywnie, tak jak aplikacja do pracy z DNA. Ponadto może być konieczna zmiana rozszerzenia pliku .fas na .txt, aby edytor tekstu mógł je rozpoznać.
Po otwarciu pliku w edytorze tekstu lub edytorze kodu źródłowego można modyfikować właściwości pliku FAS, w tym sekwencję. Jeśli jednak plik zostanie nieprawidłowo zmodyfikowany, sekwencja może ulec uszkodzeniu.
Jak przekonwertować plik FAS
Kilka aplikacji, w tym GSL Biotech SnapGene i Heracle BioSoft DNA Baser, może konwertować pliki FAS na inne formaty.
Na przykład SnapGene może konwertować pliki FAS do następujących formatów: