.FAS Extensão de arquivo
Arquivo de sequência FASTA
| Desenvolvedor | David J. Lipman and William R. Pearson |
| Popularidade |
3,2 | 6 Votos |
Um arquivo FAS é um arquivo de texto simples salvo no formato FASTA, um formato de arquivo usado para armazenar sequências de ácidos nucleicos e proteínas. Ele contém uma ou mais sequências, que incluem um código de identificação da sequência e a sequência. Estudantes de bioquímica, acadêmicos e profissionais podem usar arquivos FAS para armazenar e processar informações de bioinformática, como os genomas de diferentes espécies.
Mais informações
David J. Lipman e William R. Pearson criaram o formato FASTA e o lançaram em 1985. Desde então, ele se tornou um formato padrão para transferir sequências entre aplicativos devido à sua simplicidade.
O formato FASTA
O formato FASTA é simples e consiste nos seguintes elementos:
- Uma linha que começa com o caractere > e é seguida por um código de identificação da sequência. Uma descrição de texto da sequência pode vir depois do código, mas isso é opcional, e o software de DNA pode ignorá-la.
- A linha seguinte é a própria sequência, que pode ter mais de uma linha.
NOTA: Os arquivos FAS podem ser salvos com outras extensões de arquivo, como .fasta (.FASTA arquivos) e .fa (.FA arquivos), mas são salvos no mesmo formato FASTA.
Como abrir um arquivo FAS
Você pode abrir um arquivo FAS com vários aplicativos de DNA, como GSL Biotech SnapGene (multiplataforma), Genome Compiler (multiplataforma) e Heracle BioSoft DNA Baser (Windows). Para abrir um arquivo FAS com o SnapGene, selecione .
Abrindo um arquivo FAS com um editor de texto
Como os arquivos FAS são salvos em texto simples, você também pode abri-los com um editor de texto, como o Microsoft Notepad (Windows) ou o Apple TextEdit (Mac), ou com um editor de código-fonte. Lembre-se de que um editor de texto ou de código-fonte não exibirá a sequência no arquivo FAS nativamente como um aplicativo de DNA. Além disso, talvez seja necessário renomear a extensão de arquivo .fas para .txt para que o editor de texto a reconheça.
Quando aberto em um editor de texto ou de código-fonte, você pode modificar as propriedades do arquivo FAS, incluindo a sequência. No entanto, se editar o arquivo incorretamente, poderá corromper a sequência.
Como converter um arquivo FAS
Vários aplicativos, incluindo GSL Biotech SnapGene e Heracle BioSoft DNA Baser, podem converter arquivos FAS para outros formatos.
Por exemplo, o SnapGene pode converter arquivos FAS para os seguintes formatos:
- .DNA - Arquivo de DNA do SnapGene
- .SEQ - Arquivo de texto de sequência de DNA
- .EMBL - Arquivo de dados de sequência EMBL
- .GBK - Arquivo de dados GenBank
- .TXT - Arquivo de texto simples
- .JPG - Imagem JPEG
- .PNG - Gráfico de rede portátil
- .SVG - Arquivo de gráficos vetoriais escaláveis
- .PDF - Formato de documento portátil