.FASTA Extensão de arquivo
Arquivo de sequência FASTA
| Desenvolvedor | David J. Lipman and William R. Pearson |
| Popularidade |
3,7 | 29 Votos |
O que é um arquivo FASTA?
Um arquivo FASTA contém um registro de sequências de ácidos nucleicos (como sequências de DNA) ou sequências de proteínas salvas no formato FASTA baseado em texto. Ele pode armazenar uma ou várias sequências, por isso o FASTA às vezes é chamado de formato de banco de dados FASTA. Os usuários podem visualizar e analisar arquivos FASTA com softwares de análise de DNA.
Mais informações
David J. Lipman e William R. Pearson criaram o formato FASTA e o lançaram em 1985. Muitos aplicativos de DNA adotaram suporte ao formato devido à sua simplicidade, tornando-o um dos formatos mais comuns para transferir sequências entre aplicativos.
O formato FASTA
Os arquivos FASTA geralmente começam com uma linha de cabeçalho que pode conter comentários ou outras informações. O restante do arquivo contém dados de sequência. Cada sequência começa com um caractere > seguido pelo nome da sequência. O restante da linha descreve a sequência, e as linhas restantes contêm a própria sequência.
NOTA: Os arquivos salvos no formato FASTA podem usar várias extensões de arquivo além de .fasta, como .fas (arquivos .FAS) e .fa (arquivos .FA).
Como abrir um arquivo FASTA
Você pode abrir um arquivo FASTA com vários aplicativos de DNA, como GSL Biotech SnapGene (multiplataforma), Genome Compiler (multiplataforma) e Heracle BioSoft DNA Baser (Windows). Por exemplo, você pode abrir um arquivo FASTA no SnapGene selecionando .
Abrindo um arquivo FASTA com um editor de texto
Você também pode abrir um arquivo FASTA com um editor de texto, como o Microsoft Notepad (Windows) ou o Apple TextEdit (Mac). Também é possível abrir um arquivo FASTA com editores de código-fonte. No entanto, abrir o arquivo FASTA com um editor de texto ou de código-fonte não exibirá nativamente a sequência contida no arquivo FASTA como um aplicativo de DNA faria.
Quando aberto em um editor de texto ou de código-fonte, você pode visualizar a sequência no arquivo FASTA e modificar suas propriedades. No entanto, se editar a sequência incorretamente, você poderá corrompê-la.
Como converter um arquivo FASTA
Vários aplicativos, como GSL Biotech SnapGene e Heracle BioSoft DNA Baser, podem converter arquivos FASTA para outros formatos.
Por exemplo, o SnapGene pode converter arquivos FASTA para os seguintes formatos:
- .DNA - Arquivo de DNA do SnapGene
- .SEQ - Arquivo de texto de sequência de DNA
- .EMBL - Arquivo de dados de sequência EMBL
- .GBK - Arquivo de dados GenBank
- .TXT - Arquivo de texto simples
- .JPG - Imagem JPEG
- .PNG - Gráfico de rede portátil
- .SVG - Arquivo Scalable Vector Graphics
- .PDF - Portable Document Format