.FASTA Extensión de archivo
Archivo de secuencias FASTA
| Desarrollador | David J. Lipman and William R. Pearson |
| Popularidad |
3.7 | 29 Votos |
¿Qué es un archivo FASTA?
Un archivo FASTA contiene un registro de secuencias de ácidos nucleicos (como secuencias de ADN) o secuencias de proteínas guardadas en el formato FASTA basado en texto. Puede almacenar una o varias secuencias, por lo que a veces FASTA se denomina formato de base de datos FASTA. Los usuarios pueden ver y analizar archivos FASTA con software de análisis de ADN.
Más información
David J. Lipman y William R. Pearson crearon el formato FASTA y lo publicaron en 1985. Muchas aplicaciones de ADN han adoptado la compatibilidad con el formato debido a su simplicidad, lo que lo convierte en uno de los formatos más comunes para transferir secuencias entre aplicaciones.
El formato FASTA
Los archivos FASTA suelen comenzar con una línea de encabezado que puede contener comentarios u otra información. El resto del archivo contiene datos de secuencias. Cada secuencia comienza con un carácter > seguido del nombre de la secuencia. El resto de la línea describe la secuencia, y las líneas restantes contienen la propia secuencia.
NOTA: Los archivos guardados en el formato FASTA pueden usar varias extensiones de archivo además de .fasta, como .fas (.FAS archivos) y .fa (.FA archivos).
Cómo abrir un archivo FASTA
Puedes abrir un archivo FASTA con varias aplicaciones de ADN, como GSL Biotech SnapGene (multiplataforma), Genome Compiler (multiplataforma) y Heracle BioSoft DNA Baser (Windows). Por ejemplo, puedes abrir un archivo FASTA con SnapGene seleccionando .
Abrir un archivo FASTA con un editor de texto
También puedes abrir un archivo FASTA con un editor de texto, como Microsoft Notepad (Windows) o Apple TextEdit (Mac). También puedes abrir un archivo FASTA con editores de código fuente. Sin embargo, abrir el archivo FASTA con un editor de texto o un editor de código fuente no mostrará de forma nativa la secuencia del archivo FASTA como lo hace una aplicación de ADN.
Cuando se abre en un editor de texto o un editor de código fuente, puedes ver la secuencia del archivo FASTA y modificar sus propiedades. Sin embargo, si editas la secuencia incorrectamente, puedes dañarla.
Cómo convertir un archivo FASTA
Varias aplicaciones, como GSL Biotech SnapGene y Heracle BioSoft DNA Baser, pueden convertir archivos FASTA a otros formatos.
Por ejemplo, SnapGene puede convertir archivos FASTA a los siguientes formatos:
- .DNA - Archivo de ADN de SnapGene
- .SEQ - Archivo de texto de secuencia de ADN
- .EMBL - Archivo de datos de secuencia EMBL
- .GBK - Archivo de datos de GenBank
- .TXT - Archivo de texto sin formato
- .JPG - Imagen JPEG
- .PNG - Gráfico de red portátil
- .SVG - Archivo de gráficos vectoriales escalables
- .PDF - Formato de documento portátil