.FASTA Rozszerzenie pliku
Plik sekwencji FASTA
| Deweloper | David J. Lipman and William R. Pearson |
| Popularność |
3,7 | 29 Głosów |
Czym jest plik FASTA?
Plik FASTA zawiera zapis sekwencji kwasów nukleinowych (takich jak sekwencje DNA) lub sekwencji białek zapisanych w tekstowym formacie FASTA. Może przechowywać jedną lub wiele sekwencji, dlatego FASTA jest czasami nazywany formatem bazy danych FASTA. Użytkownicy mogą wyświetlać i analizować pliki FASTA za pomocą oprogramowania do analizy DNA.
Więcej informacji
David J. Lipman i William R. Pearson stworzyli format FASTA i opublikowali go w 1985 roku. Wiele aplikacji do analizy DNA obsługuje ten format ze względu na jego prostotę, dzięki czemu jest on jednym z najczęściej używanych formatów do przesyłania sekwencji między aplikacjami.
Format FASTA
Pliki FASTA często zaczynają się od wiersza nagłówka, który może zawierać komentarze lub inne informacje. Pozostała część pliku zawiera dane sekwencji. Każda sekwencja zaczyna się od znaku >, po którym następuje nazwa sekwencji. Reszta wiersza opisuje sekwencję, a pozostałe wiersze zawierają samą sekwencję.
UWAGA: Pliki zapisane w formacie FASTA mogą używać różnych rozszerzeń plików oprócz .fasta, takich jak .fas (pliki .FAS) i .fa (pliki .FA).
Jak otworzyć plik FASTA
Plik FASTA można otworzyć za pomocą kilku aplikacji do analizy DNA, takich jak GSL Biotech SnapGene (wieloplatformowa), Genome Compiler (wieloplatformowa) i Heracle BioSoft DNA Baser (Windows). Na przykład plik FASTA można otworzyć w programie SnapGene, wybierając .
Otwieranie pliku FASTA za pomocą edytora tekstu
Plik FASTA można także otworzyć za pomocą edytora tekstu, takiego jak Microsoft Notepad (Windows) lub Apple TextEdit (Mac). Plik FASTA można również otworzyć za pomocą edytorów kodu źródłowego. Jednak otwarcie pliku FASTA w edytorze tekstu lub edytorze kodu źródłowego nie spowoduje natywnego wyświetlenia sekwencji zawartej w pliku FASTA tak jak w aplikacji do analizy DNA.
Po otwarciu pliku w edytorze tekstu lub edytorze kodu źródłowego można wyświetlić sekwencję zawartą w pliku FASTA i zmodyfikować jej właściwości. Jeśli jednak sekwencja zostanie nieprawidłowo edytowana, może ulec uszkodzeniu.
Jak przekonwertować plik FASTA
Różne aplikacje, takie jak GSL Biotech SnapGene i Heracle BioSoft DNA Baser, mogą konwertować pliki FASTA do innych formatów.
Na przykład program SnapGene może konwertować pliki FASTA do następujących formatów: