.FAS Extension de fichier
Fichier de séquences FASTA
| Développeur | David J. Lipman and William R. Pearson |
| Popularité |
3,2 | 6 Votes |
Un fichier FAS est un fichier texte brut enregistré au format FASTA, un format de fichier utilisé pour stocker des séquences d'acides nucléiques et de protéines. Il contient une ou plusieurs séquences, qui comprennent un code d'identification de séquence et la séquence. Les étudiants en biochimie, les universitaires et les professionnels peuvent utiliser les fichiers FAS pour stocker et traiter des informations bioinformatiques, telles que les génomes de différentes espèces.
Plus d'informations
David J. Lipman et William R. Pearson ont créé le format FASTA et l'ont publié en 1985. Il est depuis devenu un format standard pour transférer des séquences entre applications en raison de sa simplicité.
Le format FASTA
Le format FASTA est simple et se compose des éléments suivants :
- Une ligne commençant par le caractère >, suivi d'un code d'identification de séquence. Une description textuelle de la séquence peut suivre le code, mais cela est facultatif et le logiciel d'ADN peut l'ignorer.
- La ligne suivante contient la séquence elle-même, qui peut s'étendre sur plusieurs lignes.
REMARQUE : Les fichiers FAS peuvent être enregistrés avec d'autres extensions de fichier, telles que .fasta (fichiers .FASTA) et .fa (fichiers .FA), mais ils sont enregistrés au même format FASTA.
Comment ouvrir un fichier FAS
Vous pouvez ouvrir un fichier FAS avec diverses applications d'ADN, telles que GSL Biotech SnapGene (multiplateforme), Genome Compiler (multiplateforme) et Heracle BioSoft DNA Baser (Windows). Pour ouvrir un fichier FAS avec SnapGene, sélectionnez .
Ouvrir un fichier FAS avec un éditeur de texte
Comme les fichiers FAS sont enregistrés en texte brut, vous pouvez également les ouvrir avec un éditeur de texte, tel que Microsoft Notepad (Windows) ou Apple TextEdit (Mac), ou avec un éditeur de code source. Notez qu'un éditeur de texte ou de code source n'affichera pas nativement la séquence du fichier FAS comme le ferait une application d'ADN. Vous devrez peut-être aussi renommer l'extension de fichier .fas en .txt pour que l'éditeur de texte la reconnaisse.
Lorsqu'il est ouvert dans un éditeur de texte ou de code source, vous pouvez modifier les propriétés du fichier FAS, y compris la séquence. Toutefois, si vous modifiez incorrectement le fichier, vous risquez de corrompre la séquence.
Comment convertir un fichier FAS
Plusieurs applications, dont GSL Biotech SnapGene et Heracle BioSoft DNA Baser, peuvent convertir les fichiers FAS vers d'autres formats.
Par exemple, SnapGene peut convertir les fichiers FAS vers les formats suivants :
- .DNA - Fichier ADN SnapGene
- .SEQ - Fichier texte de séquence ADN
- .EMBL - Fichier de données de séquence EMBL
- .GBK - Fichier de données GenBank
- .TXT - Fichier texte brut
- .JPG - Image JPEG
- .PNG - Graphique réseau portable
- .SVG - Fichier de graphiques vectoriels adaptables
- .PDF - Format de document portable