.CRAM 文件扩展名

压缩比对文件

开发者 EBI
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什么是 CRAM 文件?

由欧洲分子生物学实验室的分支机构EBI开发的压缩比对文件格式;用于存储由BWA、BBMap和BLAT等短读长比对工具生成的短DNA序列读段比对结果。

更多信息

CRAM文件格式与二进制比对/映射(BAM)文件格式类似,但具有更好的文件压缩效果,并采用了重新设计的面向列的二进制容器格式。随着遗传软件领域中的数据量不断增加,CRAM格式旨在减少比对数据占用的磁盘空间。

短读长比对是确定某个序列在基因组中来源位置的过程。由于参考基因组相当庞大,并且你不一定总是在参考基因组中寻找完全匹配的序列,因此这可能比较困难。短读长比对工具用于在海量序列中搜索匹配和近似匹配。由于序列非常庞大,CRAM等格式提供的压缩对于将文件大小保持在可管理范围内十分必要。

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可打开 CRAM 文件的程序

Windows
免费
分类:数据
更新时间:2016年1月11日

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