.CRAM ファイル拡張子

CRAMファイル形式はBinary Alignment/Map（BAM）ファイル形式に似ていますが、ファイル圧縮率が高く、列指向の再構成されたバイナリコンテナ形式を使用します。遺伝学ソフトウェア分野でデータ量が増加する中、CRAM形式はアラインメントデータのディスク容量を削減するために設計されました。

ショートリードアラインメントとは、ある配列がゲノムのどこに由来するかを解読するプロセスです。参照ゲノムはかなり大きく、参照ゲノム内で常に完全一致を探すとは限らないため、これは難しい場合があります。ショートリードアライナーは、非常に大きな配列から一致やほぼ一致する部分を検索するために使用されます。配列は非常に大きいため、CRAMのような形式による圧縮は、ファイルサイズを管理しやすく保つために必要です。