.CRAM 파일 확장자
압축 정렬 파일
| 개발사 | EBI |
| 인기도 |
2.5 | 2 표 |
CRAM 파일이란 무엇인가요?
유럽 분자생물학 연구소의 산하 기관인 EBI가 개발한 압축 정렬 파일 형식으로, BWA, BBMap, BLAT와 같은 짧은 리드 정렬 도구에서 생성된 짧은 DNA 서열 리드 정렬을 저장합니다.
추가 정보
CRAM 파일 형식은 Binary Alignment/Map(BAM) 파일 형식과 비슷하지만, 파일 압축 성능이 더 뛰어나고 열 지향 방식으로 재구성된 바이너리 컨테이너 형식을 사용합니다. 유전학 소프트웨어 분야의 데이터 양이 증가함에 따라 CRAM 형식은 정렬 데이터의 디스크 사용 공간을 줄이도록 설계되었습니다.
짧은 리드 정렬은 서열이 게놈의 어디에서 유래했는지 알아내는 과정입니다. 참조 게놈이 상당히 크고, 참조 게놈에서 항상 정확히 일치하는 항목을 찾는 것은 아니기 때문에 이 과정은 어려울 수 있습니다. 짧은 리드 정렬 도구는 방대한 서열에서 일치하거나 거의 일치하는 항목을 찾는 데 사용됩니다. 서열이 매우 크기 때문에 CRAM과 같은 형식이 제공하는 압축은 파일 크기를 관리 가능한 수준으로 유지하는 데 필요합니다.
CRAM 파일을 여는 프로그램
Windows
무료