.CRAM Extensão de arquivo
Arquivo de alinhamento compactado
| Desenvolvedor | EBI |
| Popularidade |
2,5 | 2 Votos |
O que é um arquivo CRAM?
Formato de arquivo de alinhamento compactado desenvolvido pelo EBI, uma unidade do Laboratório Europeu de Biologia Molecular; armazena alinhamentos de leituras curtas de sequências de DNA gerados por alinhadores de leituras curtas, como BWA, BBMap e BLAT.
Mais informações
O formato de arquivo CRAM é semelhante ao formato de arquivo Binary Alignment/Map (BAM), mas oferece melhor compactação de arquivos e um formato de contêiner binário reestruturado e orientado a colunas. À medida que os volumes de dados aumentam no campo dos softwares genéticos, o formato CRAM foi desenvolvido para reduzir o espaço em disco ocupado pelos dados de alinhamento.
O alinhamento de leituras curtas é o processo de descobrir de onde uma sequência vem no genoma. Isso pode ser difícil, pois o genoma de referência é bastante grande e nem sempre você está procurando correspondências exatas no genoma de referência. Os alinhadores de leituras curtas são usados para procurar correspondências e correspondências aproximadas em sequências enormes. Como as sequências são tão grandes, a compactação fornecida por formatos como o CRAM é necessária para manter os tamanhos dos arquivos sob controle.