.CRAM Estensione file
File di allineamento compresso
| Sviluppatore | EBI |
| Popolarità |
2,5 | 2 Voti |
Che cos'è un file CRAM?
Formato di file per allineamenti compressi sviluppato da EBI, una struttura distaccata dell'European Molecular Biology Laboratory; memorizza gli allineamenti di brevi sequenze di DNA generati da allineatori di letture corte come BWA, BBMap e BLAT.
Maggiori informazioni
Il formato di file CRAM è simile al formato di file Binary Alignment/Map (BAM), ma offre una compressione dei file migliore e un formato contenitore binario ristrutturato e orientato alle colonne. Con l'aumento dei volumi di dati nel campo dei software genetici, il formato CRAM è stato progettato per ridurre lo spazio su disco occupato dai dati di allineamento.
L'allineamento di letture corte è il processo di determinazione della provenienza di una sequenza nel genoma. Questo può essere difficile, poiché il genoma di riferimento è piuttosto grande e non sempre si cercano corrispondenze esatte nel genoma di riferimento. Gli allineatori di letture corte vengono utilizzati per cercare corrispondenze e quasi corrispondenze in sequenze enormi. Poiché le sequenze sono così grandi, la compressione fornita da formati come CRAM è necessaria per mantenere gestibili le dimensioni dei file.