.CRAM Extensión de archivo
Archivo de alineación comprimido
| Desarrollador | EBI |
| Popularidad |
2.5 | 2 Votos |
¿Qué es un archivo CRAM?
Formato de archivo de alineación comprimido desarrollado por EBI, una sede externa del Laboratorio Europeo de Biología Molecular; almacena alineaciones de lecturas cortas de secuencias de ADN generadas por alineadores de lecturas cortas como BWA, BBMap y BLAT.
Más información
El formato de archivo CRAM es similar al formato de archivo Binary Alignment/Map (BAM), pero ofrece una mejor compresión de archivos y un formato de contenedor binario reestructurado y orientado a columnas. A medida que aumentan los volúmenes de datos en el campo del software genético, el formato CRAM se diseñó para reducir el espacio en disco de los datos de alineación.
La alineación de lecturas cortas es el proceso de descifrar de dónde proviene una secuencia en el genoma. Esto puede ser difícil, ya que el genoma de referencia es bastante grande y no siempre se buscan coincidencias exactas en él. Los alineadores de lecturas cortas se utilizan para buscar coincidencias y coincidencias aproximadas en secuencias enormes. Como las secuencias son tan grandes, la compresión proporcionada por formatos como CRAM es necesaria para mantener los tamaños de archivo manejables.