.FAA Bestandsextensie

FASTA-sequentiebestand

Ontwikkelaar	David J. Lipman and William R. Pearson
Populariteit	3,3 \| 3 stemmen

Wat is een FAA-bestand?

Een FAA-bestand bevat een registratie van een of meer nucleïnezuur- of eiwitsequenties die zijn opgeslagen in de FASTA-indeling. Elke sequentie bevat een identificatiecode en de sequentie in tekst zonder opmaak. Verschillende DNA-sequencingprogramma's ondersteunen de indeling, en tekst- en broncode-editors kunnen de indeling ook openen.

Meer informatie

Schermafbeelding van een .faa-bestand in GSL Biotech SnapGene 6 — FAA-bestand geopend in GSL Biotech SnapGene 6

David J. Lipman en William R. Pearson hebben de FASTA-indeling gemaakt en deze in 1985 uitgebracht. Studenten biochemie, academici en professionals werken vaak met FAA-bestanden bij het opslaan en verwerken van bio-informatica-informatie.

De FASTA-indeling

FAA-bestanden zijn een van de verschillende bestanden die in de FASTA-indeling worden opgeslagen. Voorbeelden van andere bestanden zijn .FASTA, .FAS en .FA.

De FASTA-indeling begint met het teken > in de koptekst, gevolgd door een identificatiecode van de sequentie. De volgende regel is de sequentie zelf, die uit meer dan één regel kan bestaan.

Een FAA-bestand openen

Je kunt een FAA-bestand openen met verschillende DNA-programma's, zoals GSL Biotech SnapGene (meerdere platforms), Heracle BioSoft DNA Baser (Windows) en Jalview (meerdere platforms).

Een FAA-bestand openen met een teksteditor

Je kunt een FAA-bestand openen met een teksteditor, zoals Microsoft Notepad (Windows) of Apple TextEdit (Mac). Als je het FAA-bestand echter met een teksteditor opent, wordt de sequentie in het FAA-bestand niet weergegeven zoals in een DNA-programma dat de indeling van nature ondersteunt.

Wanneer je het bestand in een teksteditor opent, kun je de sequentie in het FAA-bestand bekijken en de eigenschappen ervan wijzigen. Als je de sequentie echter verkeerd bewerkt, kan deze beschadigd raken.