.FAA ファイル拡張子

FASTA配列ファイル

開発元 David J. Lipman and William R. Pearson
人気度
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FAAファイルとは?

FAAファイルには、FASTA形式で保存された1つ以上の核酸またはタンパク質配列の記録が保存されています。各配列には識別コードと、プレーンテキスト形式の配列が含まれています。さまざまなDNAシーケンシングアプリケーションがこの形式をサポートしており、テキストエディターやソースコードエディターでも開くことができます。

詳細情報

GSL Biotech SnapGene 6で開いた.faaファイルのスクリーンショット
GSL Biotech SnapGene 6で開いたFAAファイル

David J. LipmanとWilliam R. PearsonがFASTA形式を作成し、1985年に公開しました。生化学を学ぶ学生、学者、専門家は、生物情報学の情報を保存および処理するときにFAAファイルを使用することがよくあります。

FASTA形式

FAAファイルは、FASTA形式で保存される複数のファイルの1つです。その他のファイルの例として、.FASTA、.FAS、.FAがあります。

FASTA形式では、ヘッダーの先頭に>文字があり、その後に配列識別コードが続きます。 次の行には配列そのものが記載され、複数行にわたる場合もあります。

FAAファイルの開き方

GSL Biotech SnapGene(マルチプラットフォーム)、Heracle BioSoft DNA Baser(Windows)、Jalview(マルチプラットフォーム)など、さまざまなDNAアプリケーションでFAAファイルを開くことができます。

テキストエディターでFAAファイルを開く

Apple TextEdit 1で開いたFAAファイル
Apple TextEdit 1で開いたFAAファイル

Microsoft Notepad(Windows)やApple TextEdit(Mac)などのテキストエディターでFAAファイルを開くこともできます。ただし、テキストエディターでFAAファイルを開いても、FAA形式をネイティブにサポートするDNAアプリケーションのように、FAAファイル内の配列が表示されるわけではありません。

テキストエディターで開くと、FAAファイル内の配列を表示し、そのプロパティを変更できます。ただし、配列を誤って編集すると、配列が破損する可能性があります。

FAAファイルの変換方法

GSL Biotech SnapGeneやHeracle BioSoft DNA Baserなど、いくつかのアプリケーションでFAAファイルを他の形式に変換できます。

たとえば、SnapGeneではFAAファイルを次の形式に変換できます。

  • .DNA - SnapGene DNAファイル
  • .SEQ - DNA配列テキストファイル
  • .EMBL - EMBL配列データファイル
  • .GBK - GenBankデータファイル
  • .TXT - プレーンテキストファイル
  • .JPG - JPEG画像
  • .PNG - Portable Network Graphic
  • .SVG - Scalable Vector Graphicsファイル
  • .PDF - Portable Document Format
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FAAファイルを開くプログラム

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FileInfo.comによる検証済み

FileInfo.comチームは、このページに掲載されているFASTA配列ファイル形式とMac、Windows、Linuxアプリについて独自に調査しました。私たちの目標は100%の正確性であり、検証済みのファイルタイプに関する情報のみを公開しています。

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