.FAA Extension de fichier

Fichier de séquences FASTA

Développeur	David J. Lipman and William R. Pearson
Popularité	3,3 \| 3 Votes

Qu'est-ce qu'un fichier FAA ?

Un fichier FAA stocke un enregistrement d’une ou plusieurs séquences d’acides nucléiques ou de protéines enregistrées au format FASTA. Chaque séquence comprend un code d’identification et la séquence en texte brut. Diverses applications de séquençage de l’ADN prennent en charge ce format, et les éditeurs de texte et de code source peuvent également l’ouvrir.

Plus d'informations

Capture d'écran d'un fichier .faa dans GSL Biotech SnapGene 6 — Fichier FAA ouvert dans GSL Biotech SnapGene 6

David J. Lipman et William R. Pearson ont créé le format FASTA et l’ont publié en 1985. Les étudiants en biochimie, les universitaires et les professionnels utilisent souvent les fichiers FAA pour stocker et traiter des informations de bio-informatique.

Le format FASTA

Les fichiers FAA sont l’un des différents types de fichiers enregistrés au format FASTA. Parmi les autres fichiers figurent .FASTA, .FAS et .FA.

Le format FASTA commence par le caractère > dans l’en-tête, suivi d’un code d’identification de la séquence. La ligne suivante contient la séquence elle-même, qui peut s’étendre sur plusieurs lignes.

Comment ouvrir un fichier FAA

Vous pouvez ouvrir un fichier FAA avec diverses applications d’ADN, telles que GSL Biotech SnapGene (multiplateforme), Heracle BioSoft DNA Baser (Windows) et Jalview (multiplateforme).

Ouverture d’un fichier FAA avec un éditeur de texte

Fichier FAA ouvert dans Apple TextEdit 1

Vous pouvez ouvrir un fichier FAA avec un éditeur de texte, tel que Microsoft Notepad (Windows) ou Apple TextEdit (Mac). Cependant, l’ouverture du fichier FAA avec un éditeur de texte n’affichera pas la séquence qu’il contient de la même manière qu’une application d’ADN qui la prend nativement en charge.

Lorsqu’il est ouvert dans un éditeur de texte, vous pouvez afficher la séquence du fichier FAA et modifier ses propriétés. Toutefois, si vous modifiez incorrectement la séquence, vous risquez de l’endommager.