Integrated Genome Browser

Visão geral do software

O Integrated Genome Browser (IGB) é um programa de código aberto usado para visualizar e explorar grandes conjuntos de dados genômicos. Você pode visualizar vários formatos de dados, interagir com seus dados, criar gráficos, salvar suas informações como imagens e compartilhar seus dados com colaboradores.

O IGB permite visualizar dados de anotações e sequências alinhadas. O programa é compatível com vários formatos, como FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband e GenBank. Você pode transformar os dados em vários tipos de gráficos, incluindo gráficos de incompatibilidades para destacar diferenças nos dados e gráficos de profundidade para mostrar a cobertura. Você também pode interagir com seus dados por meio das animações de zoom e panorâmica do IGB.

O IGB permite acessar e carregar genomas de sites QuickLoad, que são sistemas simples de diretórios, sequências e outros arquivos de dados para fins de visualização. O IGB oferece funcionalidades avançadas com suporte a plug-ins para adicionar recursos e automatizar fluxos de trabalho por meio do uso de scripts. O IGB também oferece recursos avançados para compartilhar seus dados, seja publicando-os como uma imagem JPEG, PNG ou SVG de alta qualidade, seja armazenando-os no Dropbox para permitir que seus colaboradores acessem o projeto.

O IGB é usado principalmente por pesquisadores universitários, biólogos e bioinformatas. Ele oferece ferramentas avançadas para abrir vários formatos de dados genômicos, visualizar dados como diferentes tipos de gráficos e compartilhar dados com colaboradores. Infelizmente, o programa depende de subsídios para continuar sendo desenvolvido, o que significa que o suporte ao aplicativo pode ser encerrado a qualquer momento. No entanto, o Integrated Genome Browser continua sendo um programa capaz e personalizável para usuários que desejam explorar e analisar seus dados genômicos.

Tipo de arquivo principal

.XMLArquivo XML

Tipos de arquivo compatíveis