Integrated Genome Browser

Přehled softwaru

Integrated Genome Browser (IGB) je program s otevřeným zdrojovým kódem sloužící k prohlížení a zkoumání rozsáhlých genomických dat. Můžete prohlížet různé datové formáty, pracovat se svými daty, vytvářet grafy, ukládat informace jako obrázky a sdílet svá data se spolupracovníky.

IGB umožňuje prohlížet data z anotací a zarovnaných sekvencí. Program podporuje různé formáty, například FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband a GenBank. Data můžete převádět do různých typů grafů, včetně grafů neshod pro zvýraznění rozdílů v datech a grafů hloubky pro zobrazení pokrytí. Se svými daty můžete také pracovat pomocí animací přibližování a posouvání v IGB.

IGB umožňuje přistupovat ke genomům z webů QuickLoad a načítat je. Tyto weby představují jednoduché systémy adresářů, sekvencí a dalších datových souborů určených k vizualizaci. IGB poskytuje pokročilé funkce s podporou zásuvných modulů pro přidání funkcí a automatizaci pracovních postupů pomocí skriptů. IGB vám také nabízí pokročilé možnosti sdílení dat, ať už jejich publikováním ve vysoce kvalitním obrázku JPEG, PNG nebo SVG, nebo uložením dat do Dropboxu, aby k vašemu projektu měli přístup spolupracovníci.

IGB používají především univerzitní výzkumní pracovníci, biologové a bioinformatikové. Poskytuje pokročilé nástroje pro otevírání různých formátů genomických dat, vizualizaci dat v podobě různých grafů a sdílení dat se spolupracovníky. Program bohužel závisí na grantech pro další vývoj, což znamená, že podpora aplikace může být kdykoli ukončena. Integrated Genome Browser je však stále schopný a přizpůsobitelný program pro uživatele, kteří chtějí zkoumat a analyzovat svá genomická data.

Hlavní typ souboru

.XMLSoubor XML

Podporované typy souborů