.BLOW5 Extensão de arquivo
Dados binários SLOW5
| Desenvolvedor | Hasindu Gamaarachchi et al. |
| Popularidade |
1,0 | 1 Voto |
O que é um arquivo BLOW5?
Um arquivo BLOW5 é um arquivo binário que contém dados de sinais coletados usando um sequenciador de nanoporos. Ele é salvo na versão binária do formato de arquivo SLOW5. Os arquivos BLOW5 são criados convertendo arquivos FAST5 usando o kit de ferramentas Slow5tools.
Mais informações
Os arquivos FAST5 são arquivos HDF5 (.HDF) que armazenam dados brutos de sinal de corrente registrados por dispositivos da Oxford Nanopore Technologies (ONT). O formato inclui limitações que, entre outras coisas, impedem uma análise paralela eficiente. Para superar essas limitações, Hasindu Gamaarachchi e outros desenvolveram os formatos SLOW5 e BLOW5.
SLOW5 é um formato ASCII que armazena os dados de um arquivo FAST5 em texto simples. BLOW5 é a versão binária do SLOW5. Os arquivos BLOW5 podem ser compactados usando vários algoritmos de compactação, reduzindo ainda mais seu tamanho. Ambos os formatos podem ser acessados aleatoriamente usando arquivos de índice correspondentes, que usam as extensões .slow5.idx e .blow5.idx.
Como abrir um arquivo BLOW5
Você pode usar o Slow5tools (Linux, Mac) para visualizar o conteúdo de um arquivo BLOW5 e realizar outras operações nele. Por exemplo, você pode usar o Slow5tools para converter um arquivo BLOW5 para o formato SLOW5 ou FAST5 e para mesclar vários arquivos BLOW5 em um único arquivo.