.BLOW5 ファイル拡張子
SLOW5バイナリデータ
| 開発元 | Hasindu Gamaarachchi et al. |
| 人気度 |
1.0 | 1 票 |
BLOW5ファイルとは?
BLOW5ファイルは、ナノポアシーケンサーを使用して収集したシグナルデータを含むバイナリファイルです。SLOW5ファイル形式のバイナリ版で保存されます。BLOW5ファイルは、Slow5toolsツールキットを使用してFAST5ファイルを変換することで作成されます。
詳細情報
FAST5ファイルは、Oxford Nanopore Technologies(ONT)デバイスで記録した生の電流シグナルデータを保存するHDF5(.HDF)ファイルです。この形式には、効率的な並列解析を妨げる制限などがあります。これらの制限を克服するため、Hasindu GamaarachchiらはSLOW5形式とBLOW5形式を開発しました。
SLOW5は、FAST5ファイルのデータをプレーンテキストで保存するASCII形式です。BLOW5はSLOW5のバイナリ版です。BLOW5ファイルはさまざまな圧縮アルゴリズムを使用して圧縮できるため、ファイルサイズをさらに小さくできます。どちらの形式も、付属のインデックスファイルを使用してランダムアクセスできます。インデックスファイルには.slow5.idx拡張子と.blow5.idx拡張子が使用されます。
BLOW5ファイルの開き方
Slow5tools(Linux、Mac)を使用すると、BLOW5ファイルの内容を表示したり、ファイルを操作したりできます。たとえば、Slow5toolsを使用してBLOW5ファイルをSLOW5形式またはFAST5形式に変換したり、複数のBLOW5ファイルを1つのファイルに結合したりできます。
BLOW5ファイルを開くプログラム
Mac
Linux