.BLOW5 Rozszerzenie pliku
Binarne dane SLOW5
| Deweloper | Hasindu Gamaarachchi et al. |
| Popularność |
1,0 | 1 Głos |
Czym jest plik BLOW5?
Plik BLOW5 to plik binarny zawierający dane sygnału zebrane za pomocą sekwencera nanoporowego. Jest zapisywany w binarnej wersji formatu SLOW5. Pliki BLOW5 są tworzone przez konwersję plików FAST5 za pomocą zestawu narzędzi Slow5tools.
Więcej informacji
Pliki FAST5 to pliki HDF5 (.HDF) przechowujące dane surowego sygnału prądu zarejestrowane za pomocą urządzeń Oxford Nanopore Technologies (ONT). Format ten ma ograniczenia, które między innymi uniemożliwiają wydajną analizę równoległą. Aby przezwyciężyć te ograniczenia, Hasindu Gamaarachchi i inni opracowali formaty SLOW5 i BLOW5.
SLOW5 to format ASCII, który przechowuje dane z pliku FAST5 w postaci zwykłego tekstu. BLOW5 to binarna wersja formatu SLOW5. Pliki BLOW5 można kompresować za pomocą różnych algorytmów kompresji, dodatkowo zmniejszając ich rozmiar. Do obu formatów można uzyskiwać losowy dostęp za pomocą towarzyszących im plików indeksu, które używają rozszerzeń .slow5.idx i .blow5.idx.
Jak otworzyć plik BLOW5
Programu Slow5tools (Linux, Mac) można używać do wyświetlania zawartości pliku BLOW5 i wykonywania na nim innych operacji. Na przykład za pomocą programu Slow5tools można przekonwertować plik BLOW5 do formatu SLOW5 lub FAST5, a także scalić wiele plików BLOW5 w jeden plik.