.BLOW5 Extension de fichier
Données binaires SLOW5
| Développeur | Hasindu Gamaarachchi et al. |
| Popularité |
1,0 | 1 Vote |
Qu'est-ce qu'un fichier BLOW5 ?
Un fichier BLOW5 est un fichier binaire qui contient des données de signal recueillies à l’aide d’un séquenceur à nanopores. Il est enregistré dans la version binaire du format de fichier SLOW5. Les fichiers BLOW5 sont créés en convertissant des fichiers FAST5 à l’aide de la boîte à outils Slow5tools.
Plus d'informations
Les fichiers FAST5 sont des fichiers HDF5 (.HDF) qui stockent les données brutes de signal électrique enregistrées par des appareils d’Oxford Nanopore Technologies (ONT). Le format comporte des limitations qui, entre autres, empêchent une analyse parallèle efficace. Pour surmonter ces limitations, Hasindu Gamaarachchi et d’autres personnes ont développé les formats SLOW5 et BLOW5.
SLOW5 est un format ASCII qui stocke les données d’un fichier FAST5 en texte brut. BLOW5 est la version binaire de SLOW5. Les fichiers BLOW5 peuvent être compressés à l’aide de divers algorithmes de compression, ce qui réduit encore leur taille. Les deux formats permettent un accès aléatoire grâce à des fichiers d’index associés, qui utilisent les extensions .slow5.idx et .blow5.idx.
Comment ouvrir un fichier BLOW5
Vous pouvez utiliser Slow5tools (Linux, Mac) pour afficher le contenu d’un fichier BLOW5 et le manipuler de différentes manières. Par exemple, vous pouvez utiliser Slow5tools pour convertir un fichier BLOW5 au format SLOW5 ou FAST5, ainsi que pour fusionner plusieurs fichiers BLOW5 en un seul fichier.