.BLOW5 Dateiendung
SLOW5-Binärdaten
| Entwickler | Hasindu Gamaarachchi et al. |
| Beliebtheit |
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Was ist eine BLOW5-Datei?
Eine BLOW5-Datei ist eine Binärdatei, die Signaldaten enthält, die mit einem Nanoporen-Sequenzierer erfasst wurden. Sie wird in der Binärversion des SLOW5-Dateiformats gespeichert. BLOW5-Dateien werden mithilfe des Slow5tools-Toolkits durch Konvertieren von FAST5-Dateien erstellt.
Weitere Informationen
FAST5-Dateien sind HDF5-Dateien (.HDF) die Rohdaten von Stromsignalen speichern, die mit Geräten von Oxford Nanopore Technologies (ONT) aufgezeichnet wurden. Das Format weist Einschränkungen auf, die unter anderem eine effiziente parallele Analyse verhindern. Um diese Einschränkungen zu überwinden, entwickelten Hasindu Gamaarachchi und andere die Formate SLOW5 und BLOW5.
SLOW5 ist ein ASCII-Format, das die Daten einer FAST5-Datei als Klartext speichert. BLOW5 ist die Binärversion von SLOW5. BLOW5-Dateien können mithilfe verschiedener Komprimierungsalgorithmen komprimiert werden, wodurch ihre Dateigröße weiter verringert wird. Auf beide Formate kann mithilfe zugehöriger Indexdateien wahlfrei zugegriffen werden. Diese verwenden die Erweiterungen .slow5.idx und .blow5.idx.
So öffnen Sie eine BLOW5-Datei
Mit Slow5tools (Linux, Mac) können Sie den Inhalt einer BLOW5-Datei anzeigen und die Datei anderweitig bearbeiten. Sie können Slow5tools beispielsweise verwenden, um eine BLOW5-Datei in das SLOW5- oder FAST5-Format zu konvertieren, oder um mehrere BLOW5-Dateien zu einer einzigen Datei zusammenzuführen.