.BLOW5 Estensione file
Dati binari SLOW5
| Sviluppatore | Hasindu Gamaarachchi et al. |
| Popolarità |
1,0 | 1 Voto |
Che cos'è un file BLOW5?
Un file BLOW5 è un file binario che contiene dati del segnale raccolti utilizzando un sequenziatore a nanopori. Viene salvato nella versione binaria del formato di file SLOW5. I file BLOW5 vengono creati convertendo file FAST5 utilizzando il toolkit Slow5tools.
Maggiori informazioni
I file FAST5 sono file HDF5 (.HDF) che memorizzano dati grezzi del segnale di corrente registrati dai dispositivi di Oxford Nanopore Technologies (ONT). Il formato presenta alcune limitazioni che, tra le altre cose, impediscono un'analisi parallela efficiente. Per superare queste limitazioni, Hasindu Gamaarachchi e altri hanno sviluppato i formati SLOW5 e BLOW5.
SLOW5 è un formato ASCII che memorizza i dati di un file FAST5 in testo normale. BLOW5 è la versione binaria di SLOW5. I file BLOW5 possono essere compressi utilizzando diversi algoritmi di compressione, riducendo ulteriormente le dimensioni dei file. Entrambi i formati possono essere consultati mediante accesso casuale utilizzando file indice associati, che usano le estensioni .slow5.idx e .blow5.idx.
Come aprire un file BLOW5
Puoi usare Slow5tools (Linux, Mac) per visualizzare il contenuto di un file BLOW5 e manipolarlo in altro modo. Ad esempio, puoi usare Slow5tools per convertire un file BLOW5 nel formato SLOW5 o FAST5 e puoi usarlo per unire più file BLOW5 in un unico file.