.BLOW5 Bestandsextensie
Binaire SLOW5-gegevens
| Ontwikkelaar | Hasindu Gamaarachchi et al. |
| Populariteit |
1,0 | 1 stem |
Wat is een BLOW5-bestand?
Een BLOW5-bestand is een binair bestand dat signaalgegevens bevat die zijn verzameld met een nanopore-sequencer. Het wordt opgeslagen in de binaire versie van de SLOW5-bestandsindeling. BLOW5-bestanden worden gemaakt door FAST5-bestanden te converteren met de Slow5tools-toolkit.
Meer informatie
FAST5-bestanden zijn HDF5-bestanden (.HDF) waarin onbewerkte stroomsignaalgegevens worden opgeslagen die zijn vastgelegd met apparaten van Oxford Nanopore Technologies (ONT). De indeling bevat beperkingen die onder andere efficiënte parallelle analyse verhinderen. Om deze beperkingen te overwinnen, ontwikkelden Hasindu Gamaarachchi en anderen de SLOW5- en BLOW5-indelingen.
SLOW5 is een ASCII-indeling waarin de gegevens van een FAST5-bestand als platte tekst worden opgeslagen. BLOW5 is de binaire versie van SLOW5. BLOW5-bestanden kunnen worden gecomprimeerd met verschillende compressiealgoritmen, waardoor hun bestandsgrootte verder wordt verkleind. Beide indelingen kunnen willekeurig worden benaderd met bijbehorende indexbestanden, die de extensies .slow5.idx en .blow5.idx gebruiken.
Een BLOW5-bestand openen
Je kunt Slow5tools (Linux, Mac) gebruiken om de inhoud van een BLOW5-bestand te bekijken en het bestand op andere manieren te bewerken. Je kunt Slow5tools bijvoorbeeld gebruiken om een BLOW5-bestand naar de SLOW5- of FAST5-indeling te converteren, en je kunt het gebruiken om meerdere BLOW5-bestanden samen te voegen tot één bestand.