.MZML Bestandsextensie
Uitvoerbestand van een massaspectrometer
| Ontwikkelaar | HUPO Proteomics Standards Initiative |
| Populariteit |
3,0 | 1 stem |
Wat is een MZML-bestand?
Een MZML-bestand is een uitvoerbestand van een massaspectrometer dat is opgeslagen in de mzML-indeling. Het bevat in XML opgemaakte massaspectrometrische gegevens. De mzML-indeling is een standaard en open source, dus veel massaspectrometrieprogramma's kunnen MZML-bestanden maken en openen.
Meer informatie
In juni 2008 voltooide en publiceerde het HUPO Proteomics Standards Initiative (PSI) versie één van de mzML-indeling. PSI ontwikkelde deze op XML gebaseerde indeling ter vervanging van twee eerdere, concurrerende uitvoerindelingen voor massaspectrometers: mzData (ontwikkeld door PSI) en mzXML (ontwikkeld door het Seattle Proteome Center). De mzML-indeling bevat en combineert de beste functies van zowel mzData als mzXML.
Tegenwoordig kunnen verschillende massaspectrometrieprogramma's uitvoergegevens van massaspectrometers opslaan in de mzML-indeling en MZML-bestanden openen. Daarom slaan analytisch chemici en biochemici die hun uitvoergegevens van massaspectrometers willen delen deze gegevens vaak op in de mzML-indeling.
OPMERKING: Naast gegevens over de ion-massa-ladingsverhouding en intensiteit kunnen MZML-bestanden metagegevens bevatten over de instellingen en omstandigheden waaronder deze uitvoergegevens zijn vastgelegd.
Een MZML-bestand openen
Je kunt een MZML-bestand openen met verschillende programma's voor het analyseren van massaspectrometrieresultaten, waaronder:
- ProteoWizard (Windows, Linux)
- MaxQuant (Windows)
- Skyline (Windows)
Met deze programma's kun je de uitvoergegevens van de massaspectrometer in een MZML-bestand bekijken en analyseren.
Een MZML-bestand converteren
Met de MSConvert-module van ProteoWizard kun je MZML-bestanden converteren naar verschillende andere uitvoerindelingen voor massaspectrometrische gegevens, waaronder:
- mzXML
- mz5
- mzMLb
- mgf
- ms1
- cms1
- ms2
- cms2