.MZML Extension de fichier

En juin 2008, la Proteomics Standards Initiative (PSI) de la HUPO a finalisé et publié la première version du format mzML. La PSI a créé ce format basé sur XML pour remplacer deux anciens formats de sortie de spectromètre de masse concurrents : mzData (développé par la PSI) et mzXML (développé par le Seattle Proteome Center). Le format mzML intègre et combine les meilleures fonctionnalités de mzData et de mzXML.

Aujourd’hui, plusieurs applications de spectrométrie de masse peuvent enregistrer les données de sortie d’un spectromètre de masse au format mzML et ouvrir des fichiers MZML. Ainsi, les chimistes analytiques et les biochimistes qui prévoient de partager les données de sortie de leur spectromètre de masse les enregistrent souvent au format mzML.

REMARQUE : En plus des données de rapport masse/charge et d’intensité des ions, les fichiers MZML peuvent contenir des métadonnées sur les paramètres et les conditions dans lesquels ces données de sortie ont été capturées.

Vous pouvez ouvrir un fichier MZML avec plusieurs programmes d’analyse de résultats de spectrométrie de masse, notamment :

• ProteoWizard (Windows, Linux)
• MaxQuant (Windows)
• Skyline (Windows)

Ces programmes vous permettent d’afficher et d’analyser les données de sortie du spectromètre de masse contenues dans un fichier MZML.

Le module MSConvert de ProteoWizard peut convertir les fichiers MZML vers plusieurs autres formats de données de sortie de spectrométrie de masse, notamment :

• mzXML
• mz5
• mzMLb
• mgf
• ms1
• cms1
• ms2
• cms2