.MZML Přípona souboru
Soubor výstupu hmotnostního spektrometru
| Vývojář | HUPO Proteomics Standards Initiative |
| Popularita |
3,0 | 1 hlas |
Co je soubor MZML?
Soubor MZML je soubor výstupu hmotnostního spektrometru uložený ve formátu mzML. Obsahuje data hmotnostní spektrometrie ve formátu XML. Formát mzML je standardizovaný a open source, takže soubory MZML může vytvářet a otevírat mnoho aplikací pro hmotnostní spektrometrii.
Další informace
V červnu 2008 dokončila a vydala HUPO Proteomics Standards Initiative (PSI) první verzi formátu mzML. PSI vytvořila tento formát založený na XML, aby nahradila dva předchozí konkurenční formáty výstupu hmotnostních spektrometrů: mzData (vyvinutý organizací PSI) a mzXML (vyvinutý centrem Seattle Proteome Center). Formát mzML zahrnuje a kombinuje nejlepší vlastnosti formátů mzData a mzXML.
Nyní může několik aplikací pro hmotnostní spektrometrii ukládat výstupní data hmotnostního spektrometru ve formátu mzML a otevírat soubory MZML. Analytická chemici a biochemici, kteří plánují sdílet výstupní data svého hmotnostního spektrometru, proto tato data často ukládají ve formátu mzML.
POZNÁMKA: Kromě údajů o poměru hmotnosti k náboji iontů a intenzitě mohou soubory MZML obsahovat metadata o nastaveních a podmínkách, za kterých byla tato výstupní data zachycena.
Jak otevřít soubor MZML
Soubor MZML můžete otevřít pomocí několika programů pro analýzu výsledků hmotnostní spektrometrie, včetně:
- ProteoWizard (Windows, Linux)
- MaxQuant (Windows)
- Skyline (Windows)
Tyto programy umožňují zobrazit a analyzovat výstupní data hmotnostního spektrometru obsažená v souboru MZML.
Jak převést soubor MZML
Modul MSConvert programu ProteoWizard dokáže převádět soubory MZML do několika dalších formátů výstupních dat hmotnostní spektrometrie, včetně:
- mzXML
- mz5
- mzMLb
- mgf
- ms1
- cms1
- ms2
- cms2