.MZML Dateiendung
Massenspektrometer-Ausgabedatei
| Entwickler | HUPO Proteomics Standards Initiative |
| Beliebtheit |
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Was ist eine MZML-Datei?
Eine MZML-Datei ist eine Ausgabedatei eines Massenspektrometers, die im mzML-Format gespeichert wurde. Sie enthält XML-formatierte massenspektrometrische Daten. Das mzML-Format ist standardisiert und quelloffen, sodass viele Anwendungen für Massenspektrometrie MZML-Dateien erstellen und öffnen können.
Weitere Informationen
Im Juni 2008 stellte die HUPO Proteomics Standards Initiative (PSI) die erste Version des mzML-Formats fertig und veröffentlichte sie. PSI entwickelte dieses XML-basierte Format als Ersatz für zwei frühere, miteinander konkurrierende Ausgabedateiformate von Massenspektrometern: mzData (entwickelt von PSI) und mzXML (entwickelt vom Seattle Proteome Center). Das mzML-Format übernimmt und kombiniert die besten Eigenschaften von mzData und mzXML.
Heute können mehrere Anwendungen für Massenspektrometrie Ausgabedaten von Massenspektrometern im mzML-Format speichern und MZML-Dateien öffnen. Daher speichern analytische Chemiker und Biochemiker, die ihre Ausgabedaten von Massenspektrometern weitergeben möchten, diese Daten häufig im mzML-Format.
HINWEIS: Zusätzlich zu Daten zum Masse-Ladungs-Verhältnis und zur Intensität von Ionen können MZML-Dateien Metadaten zu den Einstellungen und Bedingungen enthalten, unter denen diese Ausgabedaten erfasst wurden.
So öffnen Sie eine MZML-Datei
Sie können eine MZML-Datei mit mehreren Programmen zur Analyse von Ergebnissen der Massenspektrometrie öffnen, darunter:
- ProteoWizard (Windows, Linux)
- MaxQuant (Windows)
- Skyline (Windows)
Mit diesen Programmen können Sie die in einer MZML-Datei enthaltenen Ausgabedaten des Massenspektrometers anzeigen und analysieren.
So konvertieren Sie eine MZML-Datei
Das MSConvert-Modul von ProteoWizard kann MZML-Dateien in mehrere andere Ausgabedatenformate für die Massenspektrometrie konvertieren, darunter:
- mzXML
- mz5
- mzMLb
- mgf
- ms1
- cms1
- ms2
- cms2