.MZML ファイル拡張子

2008年6月、HUPO Proteomics Standards Initiative（PSI）はmzML形式のバージョン1を完成させ、公開しました。PSIは、以前使用されていた、競合する2つの質量分析計出力形式、mzData（PSIが開発）とmzXML（Seattle Proteome Centerが開発）に代わるXMLベースの形式として、この形式を作成しました。mzML形式には、mzDataとmzXMLの両方の優れた機能が組み込まれ、統合されています。

現在では、複数の質量分析アプリケーションで質量分析計の出力データをmzML形式で保存し、MZMLファイルを開くことができます。そのため、質量分析計の出力データを共有する予定の分析化学者や生化学者は、そのデータをmzML形式で保存することがよくあります。

注: イオンの質量電荷比と強度のデータに加えて、MZMLファイルには、この出力データが取得されたときの設定や条件に関するメタデータが含まれている場合があります。

次のような複数の質量分析結果解析プログラムでMZMLファイルを開くことができます:

• ProteoWizard（Windows、Linux）
• MaxQuant（Windows）
• Skyline（Windows）

これらのプログラムを使用すると、MZMLファイルに含まれる質量分析計の出力データを表示して解析できます。

ProteoWizardのMSConvertモジュールでは、MZMLファイルを次のような複数の質量分析計出力データ形式に変換できます:

• mzXML
• mz5
• mzMLb
• mgf
• ms1
• cms1
• ms2
• cms2