MEGA
| Verze | 6(k 22.9.2015) |
| Platformy | Windows, Mac |
| Licence | Freeware |
| Kategorie | Vědecké |
Hlavní funkce
- Podpora formátů FASTA, GCG a PHYLIP
- Vytváření zarovnání sekvencí
- Testování evolučních hypotéz
- Diagnostika mutací
- Odhad doby divergence
Přehled softwaru
MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis) je nástroj pro analýzu evolučních sekvencí DNA a proteinů. Aplikace je dostupná ve verzi s rozhraním GUI a ve verzi pro příkazový řádek.
MEGA podporuje několik formátů sekvencí DNA a proteinů včetně formátů FASTA, GCG, PIR/NBRF, PHYLIP a Clustal W. Aplikaci lze použít k vytváření zarovnání sekvencí, odhadu doby divergence, odvozování fylogenetické historie, diagnostice mutací, odhadu rychlosti molekulární evoluce a testování evolučních hypotéz. Aplikace také obsahuje výukové materiály a ukázkové soubory, které začínajícím uživatelům pomohou začít.
MEGA je určena k laboratornímu výzkumu biologů, kteří rekonstruují evoluční historii genů a druhů. Podporuje několik oblíbených formátů sekvencí DNA a proteinů a zároveň nabízí nástroje k prozkoumání dat a provádění různých testů. MEGA je nezbytným nástrojem pro všechny, kdo provádějí výzkum sekvencí DNA a proteinů.
Hlavní typ souboru
.MDSXUložená relace MEGA
Podporované typy souborů
| Přípona | Typ souboru |
|---|---|
| .MDSX | Uložená relace MEGA |
| .FASTA | Soubor sekvence FASTA |
| .GCG | Soubor sekvence DNA GCG |
| .MEG | Datový soubor MEGA |
| .MTS | Soubor relace MEGA Tree |